此教程的早期版本由 Lisa Tagliaferri编写。
介绍
R是一个开源编程语言,广泛用于执行数据分析和统计计算,并得到R统计计算基金会的支持,它是一个日益流行的和可扩展的语言,具有活跃的社区。
在本教程中,您将安装 R 并显示如何从官方 全面 R 档案网络 (CRAN)中添加包。
前提条件
要跟随这个教程,你需要一个 Ubuntu 22.04 服务器:
- 至少 1GB RAM
具有
sudo
特权的非根用户
要了解如何实现此设置,请遵循我们的 初始服务器设置指南。
一旦这些先决条件到位,你就准备好开始了。
步骤 1 - 安装 R
由于R是一个快速移动的项目,最新的稳定版本并不总是从Ubuntu的存储库中可用,因此您将开始添加由CRAN维护的外部存储库。
<$>[注] 注: CRAN 维护其网络中的存储库,但并非所有外部存储库都是可靠的。
首先,您需要将 R 项目的公共 GPG 密钥添加到您的服务器,然后配置包存库. 首先,您将下载用wget
命令的密钥,并将其转换为一个格式,即apt
可以用gpg -dearmor
命令来验证下载的包。
下载密钥并安装它:
1wget -qO- https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/marutter_pubkey.asc | sudo gpg --dearmor -o /usr/share/keyrings/r-project.gpg
接下来,将 R 源列表添加到 sources.list.d
目录中,其中 APT 会搜索新的源:
1echo "deb [signed-by=/usr/share/keyrings/r-project.gpg] https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu jammy-cran40/" | sudo tee -a /etc/apt/sources.list.d/r-project.list
文件的[signed-by=/usr/share/keyrings/r-project.gpg]
部分指示apt
使用您下载的密钥来验证 R 包的存储库和文件信息。
接下来,更新您的包列表,以便 APT 读取新的 R 源:
1sudo apt update
在显示的输出中,您应该识别类似于以下的行:
1[secondary_label Output]
2...
3Get:7 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu jammy-cran40/ InRelease [3622 B]
4Get:8 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu jammy-cran40/ Packages [15.6 kB]
5...
如果上面的行出现在更新
命令的输出中,你已经成功地添加了存储库,现在你可以确定我们不会意外地安装一个较旧的版本。
此时,您已准备好使用以下命令来安装 R。
1sudo apt install --no-install-recommends r-base
如果被提示确认安装,请按y
来继续。--no-install-recommends
参数确保没有安装额外的包。
截至写作时,CRAN 的最新稳定版本为 4.2.0,当您启动 R 时显示。
由于本教程将探索为系统上的每个用户安装一个示例包,开始R作为根,以便图书馆自动为所有用户提供。
1sudo -i R
1[secondary_label Output]
2
3R version 4.2.0 (2022-04-22) -- "Vigorous Calisthenics"
4Copyright (C) 2022 The R Foundation for Statistical Computing
5Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
6. . .
7Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
8'help.start()' for an HTML browser interface to help.
9Type 'q()' to quit R.
10
11>
这确认您已经成功安装了 R 并输入了其交互式壳。
步骤 2 — 从 CRAN 安装 R 包
R 的强项之一是其可用的多种附加包。为了演示目的,您将安装 txtplot
,一个输出 ASCII 图表的库,其中包括 scatterplot、线程图、密度图、acf 和条形图表:
1install.packages('txtplot')
<$>[注] 注: 以下输出显示将安装该包的位置。
1[secondary_label Output]
2...
3Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
4(as ‘lib’ is unspecified)
5. . .
这个整个网站的路径是可用的,因为我们运行了R作为根. 这个位置将使包可供所有用户使用。
安装完成后,加载txtplot
库:
1library('txtplot')
如果没有错误消息,图书馆已成功加载,现在让我们用一个示例来示范用轴标签的基本拼图功能。由R的数据集
包提供的示例数据包含(基于20世纪20年代的数据,汽车的速度和停止所需的距离):
1txtplot(cars[,1], cars[,2], xlab = 'speed', ylab = 'distance')
1[secondary_label Output]
2 +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
3 120 + * +
4 | |
5d 100 + * +
6i | * * |
7s 80 + * * +
8t | * * * * |
9a 60 + * * * * * +
10n | * * * * * |
11c 40 + * * * * * * * +
12e | * * * * * * * |
13 20 + * * * * * +
14 | * * * |
15 0 +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
16 5 10 15 20 25
17 speed
如果您有兴趣了解更多关于txtplot的信息,请从R翻译器中使用帮助(txtplot)
。
任何预编译的软件包都可以从 CRAN 安装使用 install.packages()
. 有关可用软件的更多信息,您可以通过 Available CRAN Packages By Name list找到由名称组成的官方软件包列表。
若要退出 R,您可以键入 q()
. 当提示时,您可以按 n
,除非您想要保存工作区图像。
结论
随着 R 成功安装在您的服务器上,您可能对 安装 RStudio 服务器的本指南感兴趣,以便将 IDE 带到您刚刚完成的基于服务器的部署中。
有关如何通过利用不同的工具来安装 R 包的更多信息,您可以阅读如何直接从 GitHub、BitBucket 或其他位置安装(https://andsky.com/tech/tutorials/how-to-install-r-packages-using-devtools)。